该剧讲述了阴阳眼少年冬青与灵魂摆渡人赵吏，一同帮助因有心事未了而滞留人间的灵魂的故事。冬青有一双特别的眼睛，他可以看见鬼魂，并与之沟通。这样特殊的“能力”带来的多数是麻烦。直到有一天，他找到了一份工作，在一间24TH便利店做夜班营业员。这间便利店实际上是一间“灵魂驿站”，灵魂摆渡人赵吏孤独地在这里驻守了五百年，这里白天人来人往，夜里各种鬼魂出没，死去灵魂从这里去往黄泉之国，而每只不肯离去的鬼魂都有一个心愿。
《灵魂摆渡》并不是一部简单的“鬼故事”剧集。编剧小吉祥天非常好地把握了“惊悚”和“正能量”之间的平衡，在剧集的大部分故事中设置了巧妙的悬念与转折，总是能将包裹在惊悚氛围中的剧情最终引导到充满温情正能量或是批评社会负面元素的结局上去，让“惊悚”变得有社会意义。《灵魂摆渡》表现手法上的多元化更加凸显了其多元血统。带有《美国恐怖故事》的风格，但由于本土化改编非常成功，观众并不会有突兀之感。
