该剧改编自秦明文学作品《第十一根手指》，以法医秦明的视角展开，讲述了其与法医助理李大宝、刑警队大队长林涛组成的黄金组合携手其他警官屡破要案的故事。龙番市刑警队长林涛，与法医科科长秦明是多年的老朋友。秦明的助理因不堪忍受秦明的古怪脾气打报告辞职。痕检科的李大宝被借调加入工作小组。期初秦明对身为女生的大宝不信任，但倔强的大宝在破案中，体现出了相当不错的推理和观察能力，并且嗅觉极度灵敏，挑剔的秦明决定留下大宝。龙番警局的铁三角也初告形成。以这起“油爆奇案”为开端，秦明、大宝和林涛接连破获了各种匪夷所思的案件。
该剧最大程度还原了原著的纪实性和专业性，环环相扣的离奇案件、步步为营的破案过程，用紧张烧脑的剧情为观众呈现超强的感官刺激。虽然走得是专业高冷的法医风，该剧也有不少欢乐元素，有笑有泪。该剧剧情紧凑，故事曲折，重要的是专业知识毫不含糊，也没有浮夸的造型和飘忽玄幻的人设。自上线以来，前两集让很多抱着看大尺度刑侦剧心态的观众没有失望：从厨余垃圾、下水道中提炼地沟油，油炸尸体，满屋子蝇血，卧室衣柜中的两套完整人皮，厨房中炉子上的两锅未煮好的人肉。 “重口味，大尺度”、“减肥剧”各种标签铺天盖地，但是抛开这些为了追求逼真精益求精但又一闪而过的重口味画风，从第三集开始，《法医秦明》就露出了正能量鸡汤的本质。
