1937年至1945年抗战最艰险的期间，我党地下情工人员秦川在组织的秘密策划下，顺利打进日本驻上海特务机构梅机关。在此之前，秦川曾长期埋伏于国民党复兴社，顺利获得情报，清除了掩藏在我党组织内部的国民党特务。秦川“投靠”梅机关的讯息备受国民党军统、日本人和我党地下组织的高度关注。为了顺利执行埋伏计划，获得日军机要情报，秦川凭借聪慧和过人的胆识稳扎稳打，转危为安，不失时机地打击敌方，保卫组织。同为我党情工人员的夏岚身为秦川的爱人，用自身护士的身份掩护秦川，相知相识却无法相守，声嘶力竭的情感化为一腔报国热血。与此同时，爱国探长沈若寒和军统女特务叶琳琳卷进其中，在情感的纠葛中，为了民族大义纷纷奉献生命。最后，秦川和夏岚顺利完成了党交给的任务，夏岚却为了革命事业奋勇牺牲。
《卧底》是一部厚重的谍战情感大戏，本剧角度新，演员有新意，角色有创意，这些优点都在其优秀的故事中得到最大程度的发挥。本剧剧情紧凑，越来越有悬念，节奏张弛有度、扣人心弦。
