本剧主要叙述了降魔真君钟馗遭天庭贬职，落入人世间，记忆尽失，变为少年穆天然又因冥冥中注定，他冲破结界选择离开这个人妖魔三族和平共存之所——福禄村。而这一切竟起因于魔族神器愚下木和少年穆天然的隐秘身份，穆天然不得不在众人保护下踏向未知人世间。他相继结识天岚海阁世子杨仁执、神秘除魔师凌兮、任性而聪颖的魔族小姑娘罂粟，结成患难之交。一群人斩妖除魔，锄强扶弱，守卫世间。在一次又一次探险中，穆天然被命运所裹挟，他起先阴差阳错成了降魔机构--天岚海阁的一员，然后又阴差阳错地被魔族劫走，无缘无故变为魔族之首，意外纷沓而来，穆天然却毫不慌乱，游戏人间。却不知道，一场紧紧围绕他而起阴谋正缓缓展开。
《钟馗捉妖记》把观众广为人知的神仙，用全新的次时代表演手法，变为神话英雄的形式。这样具备次时代审美和娱乐效果的改造，还是十分独特的。
