叶昭，武功超群，从小女扮男装。叶家在战场上不幸被灭门，16岁就被朝廷委以重任，替父出征，从当初了不成器，逐渐变成威名远扬的大将军。镇守边关八年就为朝廷立下汗马功劳，因多次被召回首封赏和赐婚，无奈之下坦白自己是个女娇娃，朝野上下为之震惊。垂帘听政的太后担心叶昭手握重兵威胁皇权，便指婚给皇上的亲侄子废柴南平郡王赵玉瑾。一个是战场上杀人不眨眼、威风八面的女将军，一个是从小备受溺爱的文青男，两个人从此拉开了夫妻间谁做老大的大战。
《将军在上》让诸多女性观众产生共鸣。它并不像其他古装大女主戏表现得那样，女主看似励志，但不过是站在男性的肩膀上、通过贬低男性来衬托女主的形象。《将军在上》中的叶昭，一方面非常反对《女诫》对女性的约束和摧残，另一方面，他尊重并信任看似废柴的男主赵玉瑾，愿意与他一同在相处的过程中成长，这才是当今正确的新女性意识、健康的婚恋观。
