一九三八年，在中国抗战、国共合作环境下，蒋介石听信谗言授职西安特务机构，密裁第十八集团军高级参议、中国共产党员宣侠父，这一举动引起中共强烈抗议。无奈舆论压力，国民党迫不得已在西安建立破反专署，调察宣侠父失踪事件。中共地下党员、原中统特工武仲明，变成国共两方一同认可的破反专员。武仲明领衔的破反专署，结集了西安军、警、特和八路军西安办事处各路人马，敌中有我，我中有敌，纷繁复杂，调察之旅甫一起程即步步陷阱、危机重重！武仲明严查宣侠父案2个月间，不但是利刃上的对战，也是人性的交锋。在地下党员组织推动下，正义同道前赴后继寻觅下，武仲明总算查明真相，取得了密裁宣侠父手令。无奈证据确凿，蒋介石迫不得已向中共认账，自吞苦果。
在感情方面，《密查》违反了“男追女”的传统式套路，开演了“烈火千金强撩冰霜神探”的高虐情节，一个是新女权主义热情如火，另一个是掩藏在敌人冷若冰霜背后。“你整个人都在吸引我”“我想要的男人，谁也抢不走”，蒋宝珍的胆大和热情是谍战片中从未出现过的女性形象。
