一支结集了科考组员、冒险家、战地记者、士兵的考察队，前去前去南太平洋上的隐秘海岛——骷髅岛。这些人的出现打扰了小岛上之王——史上最强大金刚，通过几番激烈的大战后，探险队员分布在了海岛各个地方。这时，组员们才意识到本次探险并非一次单纯性的科考工作，反而是去探寻怪物存有的证实。在这一片与世独立，凶险满布的森林，许多古怪的远古生物隐藏在其中，时时刻刻威胁着这些人的生命。组员们还碰到了隐秘的原始人部落，金刚的真实身份和其守卫海岛的缘故也被慢慢掀开，原来，可怕恐怖的骷髅小岛上还蜇伏着更凶狠残暴的怪物。
说起金刚，脑海里就浮现出很多年前看过的金刚系列的电影，印象中，关于金刚大猩猩的电影，喜欢穿插铁汉柔情，与人类组CP的套路。但是《金刚骷髅岛》一反常态，这个电影里并没有强行打造金刚柔情的一面，也没有来美女与野兽的煽情故事，反而是纯粹地凸显金刚，这个骷髅岛中霸王级别的森林怪物，拳头是多硬，脾气是多么火爆，三观是多么端正。它是骷髅岛的保护神，被当地土著奉为神明般的存有。故事背景不在现代高楼大厦中，反而多了一丝野性，也不用走哥斯拉的老路，带给观众仿佛人类误入了原始森林般前去的感觉。
