电视动画第2期《科学超电磁炮S》和第3期《科学超电磁炮T》分别于2013年和2020年播出。动画的前半部分改编自原作漫画1~3卷，而后半原创部分则由《魔法禁书目录》原作者镰池和马亲自执笔担当剧本。
《魔法禁书目录》的动画化，诞生于2008年，那个时候，轻小说的那种故事进展套路，和傲娇系女主角的热潮，达到了巅峰，因此御坂美琴比起吃货+天然属性的茵蒂克丝要吃香太多，茵蒂克丝好吃懒做的形象，就是萝莉的外表也救不了她，人气被炮姐盖过太多，戏份也要出彩很多，因此御坂美琴可以说是《魔法禁书目录》中，最有代表性的女性角色，也正因为她超高的人气，催使了之后漫画版《超电磁炮》的诞生。
讲述了在面积占据东京都西部的三分之一，居住着230万名人口，其中八成人口是学生的巨大都市“学园都市”中，学园都市和外部隔离，研究最尖端科技。所有学生都接受超能力开发，并大都借由药物、催眠术与通电刺激等方式取得超能力。有各种类型不同能力，以范围和威力分为无能力者、低能力者、异能力者、强能力者、大能力者和超能力者。故事从学园都市最强的电击公主“超电磁炮”御坂美琴，某天认识了和白井黑子一样担任风纪委员的初春饰利开始。
